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* [[湯島聖堂]]（[[東京都]][[文京区]][[湯島]]）内の神農廟に祀られ、毎年[[11月23日]]に「神農祭」が行われる。湯島聖堂（東京都文京区湯島）内の神農廟に祀られ、毎年11月23日に「神農祭」が行われる。* [[薬祖神社]]（[[大阪府]][[堺市]][[戎之町]]）[[堺天神]]菅原神社の摂社として[[スクナビコナ|少彦名命]]とともに祀られ毎年11月23日に「薬祖祭」が斎行される。薬祖神社（大阪府堺市戎之町）堺天神菅原神社の摂社として少彦名命とともに祀られ毎年11月23日に「薬祖祭」が斎行される。* [[少彦名神社 (大阪市)|少彦名神社]]（[[大阪市]][[中央区 (大阪市)|中央区]]）には[[スクナビコナ|少彦名命]]とともに奉られ、毎年[[11月22日]]・23日に「神農祭」が行われる。少彦名神社（大阪市中央区）には少彦名命とともに奉られ、毎年11月22日・23日に「神農祭」が行われる。

また、日本で神農は「神農皇帝」の名称で、[[香具師]]・[[的屋|てき屋]]業界では守護神・まもり本尊として崇敬されている。これは神農の時代に物々交換などの交易をする市場がはじめられたこと、また神農の子孫であるとされる[[弓月君|融通王]]が日本ではじめての露天商であるという伝説などが理由であるとされてきたまた、日本で神農は「神農皇帝」の名称で、香具師・てき屋業界では守護神・まもり本尊として崇敬されている。これは神農の時代に物々交換などの交易をする市場がはじめられたこと、また神農の子孫であるとされる融通王が日本ではじめての露天商であるという伝説などが理由であるとされてきた<ref>佐藤一羊 『神農の由来 附・香具師虎之巻』 1930年 神農社 - [{{NDLDC|:1461093}} 国立国会図書館デジタルコレクション]</ref>。儀式では祭壇中央に掛け軸が祀られるほか、[[博徒]]の「任侠道」に相当するモラルを「神農道」と称している。。儀式では祭壇中央に掛け軸が祀られるほか、博徒の「任侠道」に相当するモラルを「神農道」と称している。