ハプログループD (mtDNA)

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ハプログループD (mtDNA)（ハプログループD (ミトコンドリアDNA)、Haplogroup D (mtDNA)）とは、分子人類学で用いられる、人類のミトコンドリアDNAハプログループ（型集団）の分類のうち、ハプログループMを祖先に持ち「4883 5178A 16362」により定義されるものである[1][2][3]。

分布

ハプログループDは48000年前に東アジアで誕生し、東アジア・東南アジア・北アジア・中央アジアそしてアメリカ大陸に至るまで広範囲に観察される。形質人類学におけるモンゴロイドの分布域と概ね重なる。日本人の約41%-42%がこの系統に属する[4][5][6]、D4は日本人の30%以上が属す最も高頻度のグループとなっているが、D5は僅か5％程度となっている[7][8][9][10][11][12]。長寿の傾向がある遺伝子とされている[7][8][9][10][11][12]。 中国中部が起源とされるハプログループDは、35%以上の日本人が該当する最大のグループである。 日本以外では中国や朝鮮半島にも多く、東アジア集団を特徴づけるグループといえる。「稲作の民」の祖先は、中国中部で原始的な稲作を開始し、その技術とともに日本へやって来たことで 弥生時代の到来に貢献したと考えられている。

下位系統

大別すると「D4」と「D5・D6」という2つの系統がある。

  • D
    • D4 (3010, 8414, 14668)　:日本人で最も多いグループであり[7][8][9][10][11][12]、北東アジアでよくみられ、日本人、朝鮮民族などでは最も高頻度で観察されるタイプであり、とりわけ日本人に於いてその頻度が高い。[6][5][13][14][15][4][16] ウィルタ、ブリヤート、カルムイク人、テレンギト人などでも最もよく見られるタイプである[13][17]。中国・中国西部・中央アジア、アメリカ先住民で広く観察される[18][19][20][21][22][23][24]。パレオ・インディアンやロシア沿海州（悪魔の門）及び中国東北部の新石器時代初期の遺跡（吉林省大安市にあるホウタオムガ遺跡、内モンゴル自治区通遼市にあるハミンマンハ遺跡等）でも最も頻繁に見られるハプログループである。
    • D5・D6 (16189)　: D5はD4よりも長い歴史を持ち[7][8][9]、3万7千年から3万2千年前頃に誕生したとされており[7][8][9]、D5'6 (16189) は主に東アジアと東南アジア、特に中国、韓国、日本で見られます。 D5a2a2 サブクレードが流行しているが、アメリカ大陸への移動には参加していないようであり、中央アジア、北アジア、南アジアでの頻度は一般的に低い (57/423 = 13.48%) [51] )ヤクートの中で、歴史的にモンゴル拡大の圧力の下でシベリアに移住したテュルク語を話すグループ。[25][7][8][9][10][11][12][26]。主に韓国、日本、中国南部で見られ、特に漢民族で観察頻度が高い、他は東南アジアでも見られる。[27][28][29] 。中央アジア、インド東部でも低頻度で見られるが、下位系統のD5a2a2がシベリアのヤクートでよくみられる[30]。D5の有名人はAAAの西島隆弘、上田晋也、濱田龍臣、糸井重里[31]。

参考文献

脚注

  1. ↑ van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). "Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation". Human Mutation 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID:18853457. Retrieved 2009-05-20.
  2. ↑ ハプログループ D (mtDNA), https://www.asianprofile.wiki/wiki/Haplogroup_D_(mtDNA) , www.asianprofile.wiki, (2022-03-09), en, hmong.wiki
  3. ↑ "Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock Supplementary material" (PDF). 2009. pp. page89.
  4. ↑ 4.0 4.1 Asari M, 2007, Utility of haplogroup determination for forensic mtDNA analysis in the Japanese population , Leg Med, vol 9, issue 5, p237–240, doi:10.1016/j.legalmed.2007.01.007, pmid:17467322
  5. ↑ 5.0 5.1 Umetsu Kazuo, Tanaka Masashi, Yuasa Isao, 2005, Multiplex amplified product-length polymorphism analysis of 36 mitochondrial single-nucleotide polymorphisms for haplogrouping of East Asian populations, Electrophoresis , vol 26, issue 1, p91–98, doi:10.1002/elps.200406129, pmid:15624129
  6. ↑ 6.0 6.1 Maruyama Sayaka , Minaguchi Kiyoshi, Saitou Naruya, 2003, Sequence polymorphisms of the mitochondrial DNA control region and phylogenetic analysis of mtDNA lineages in the Japanese population, Int J Legal Med, vol 117, issue 4, p218–225, doi:10.1007/s00414-003-0379-2, pmid:12845447
  7. ↑ 7.0 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 新版 日本人になった祖先たち―DNAが解明する多元的構造 (NHKブックス No.1255), 2019-03-25, NHK出版, 篠田謙一
  8. ↑ 8.0 8.1 8.2 8.3 8.4 8.5 DNAで語る 日本人起源論 (岩波現代全書), 2015-09-19, 岩波書店, 篠田謙一, 第7章
  9. ↑ 9.0 9.1 9.2 9.3 9.4 9.5 いつでもLOUPE:「現代日本人のもつDNA」, http://blog.livedoor.jp/nara_suimeishi/archives/51936203.html, blog.livedoor.jp, (2022-03-09)
  10. ↑ 10.0 10.1 10.2 10.3 我々はどこから来たのか-最新研究からわかる弥生時代～古墳時代のヤポネシア人のDNAについて にっぽん ってどんな国？, https://jpnhist.com/archives/1268, にっぽん　ってどんな国？, (2022-03-09), ja
  11. ↑ 11.0 11.1 11.2 11.3 古代史とミトコンドリア（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａ）, https://enkieden.exblog.jp/20932564/, 古代史探訪,(2022-03-099, ja
  12. ↑ 12.0 12.1 12.2 12.3 篠田謙一さんが語る、ミトコンドリアDNAでたどる人類の起源（1/2）, , https://bigissue-online.jp/2013/11/08/shinoda-san-1/, BIG ISSUE ONLINE, (2022-03-09), ja
  13. ↑ 13.0 13.1 Derenko M, Malyarchuk B, Denisova G, Perkova M, Rogalla U, 2012, Complete Mitochondrial DNA Analysis of Eastern Eurasian Haplogroups Rarely Found in Populations of Northern Asia and Eastern Europe, PLoS ONE, vol 7, issue 2, pe32179, doi:10.1371/journal.pone.0032179, pmid=22363811, pmc=3283723
  14. ↑ East Asian mtDNA haplogroup determination in Koreans: haplogroup-level coding region SNP analysis and subhaplogroup-level control region sequence analysis
  15. ↑ Kong Qing-Peng, Yao Yong-Gang, Liu Mu, 2003, Mitochondrial DNA sequence polymorphisms of five ethnic populations from northern China, Hum Genet, vol 113, issue 5, p391–405, doi: 10.1007/s00439-003-1004-7, pmid:12938036
  16. ↑ Zheng H-X, Yan S, Qin Z-D, Wang Y, Tan J-Z, 2011, Major Population Expansion of East Asians Began before Neolithic Time: Evidence of mtDNA Genomes, PLoS ONE, vol 6, issue 10, pe25835, doi:10.1371/journal.pone.0025835, pmid:21998705, pmc:3188578
  17. ↑ Derenko Miroslava, Malyarchuk Boris, Grzybowski Tomasz, 2007, Phylogeographic Analysis of Mitochondrial DNA in Northern Asian Populations, Am. J. Hum. Genet., vol 81, issue 5, p1025–1041, doi:10.1086/522933, pmid:17924343, pmc:2265662
  18. ↑ Malhi Ripan S., Breece Katherine E., Schultz Shook Beth A., Kaestle Frederika A., 2004, Patterns of mtDNA Diversity in Northwestern North America, Human Biology, vol 76, issue 1, p33–54, doi:10.1353/hub.2004.0023, pmid:15222679
  19. ↑ Malhi Ripan S., Mortensen Holly M., Eshleman, Jason A., 2003, Native American mtDNA Prehistory in the American Southwest, American Journal of Physical Anthropology, vol 120, issue 2, p108–124, doi:10.1002/ajpa.10138, pmid:12541329
  20. ↑ Wen Bo, Li Hui, Gao Song, 2005, Genetic Structure of Hmong-Mien Speaking Populations in East Asia as Revealed by mtDNA Lineages, Mol. Biol. Evol., vol 22, issue 3, p725–734, doi:10.1093/molbev/msi055, pmid:15548747
  21. ↑ Hill Catherine, Soares Pedro, Mormina Maru, 2006, Phylogeography and Ethnogenesis of Aboriginal Southeast Asians, Mol. Biol. Evol., vol 23, issue:12,p2480–2491, doi:10.1093/molbev/msl124, pmid:16982817
  22. ↑ Catherine Hill, Pedro Soares, Maru Mormina et al., "A Mitochondrial Stratigraphy for Island Southeast Asia", Am. J. Hum. Genet. (2007);80:29–43.
  23. ↑ Kaewsutthi Supannee, Phasukkijwatana Nopasak, Joyjinda Yutthana, Jul 2011, Mitochondrial Haplogroup Background May Influence Southeast Asian G11778A Leber Hereditary Optic Neuropathy, Invest Ophthalmol Vis Sci, vol 52, issue:7, p4742–8, doi:10.1167/iovs.10-5816, pmid:21398275
  24. ↑ Volodko Natalia V., Starikovskaya Elena B., Mazunin Ilya O., 2008, Mitochondrial Genome Diversity in Arctic Siberians, with Particular Reference to the Evolutionary History of Beringia and Pleistocenic Peopling of the Americas, The American Journal of Human Genetics, vol 82, issue:5, p1084–1100, doi:10.1016/j.ajhg.2008.03.019, pmid:18452887, pmc:2427195
  25. ↑ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC524407/
  26. ↑ 第10回 いま注目の最先端研究・技術探検！ 中高生と“いのちの不思議”を考える─生命科学DOKIDOKI研究室, https://www.terumozaidan.or.jp/labo/technology/10/03.html , www.terumozaidan.or.jp (最終閲覧日：2022-03-09)
  27. ↑ Tanaka M et al. 2004, Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan Genome Res. 2004. 14: 1832-1850
  28. ↑ Peng Min-Sheng, He Jun-Dong, Liu Hai-Xin, Zhang Ya-Ping, 2011, Tracing the legacy of the early Hainan Islanders - a perspective from mitochondrial DNA, BMC Evolutionary Biology, vol 2011, issue:11, p46, doi:10.1186/1471-2148-11-46, pmid:21324107, pmc:3048540
  29. ↑ Tabbada Kristina A., Trejaut Jean, Loo Jun-Hun, 2010, Philippine Mitochondrial DNA Diversity: A Populated Viaduct between Taiwan and Indonesia?, Mol. Biol. Evol., vol 27, issue:1, p21–31, doi :10.1093/molbev/msp215, pmid:19755666
  30. ↑ Fedorova Sardana A, Reidla Maere, Metspalu Ene, 2013, Autosomal and uniparental portraits of the native populations of Sakha (Yakutia): implications for the peopling of Northeast Eurasia, BMC Evolutionary Biology, vol 2013, issue:13, p127, doi:10.1186/1471-2148-13-127, pmid:23782551, pmc:3695835
  31. ↑ mtDNA D5系統 - 有名人のハプログループ, https://famousdna.wiki.fc2.com/wiki/mtDNA%20D5%E7%B3%BB%E7%B5%B1, famousdna.wiki.fc2.com (最終閲覧日：2022-03-09)
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