ハプログループD (mtDNA)

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ハプログループD (mtDNA)(ハプログループD (ミトコンドリアDNA)、Haplogroup D (mtDNA))とは、分子人類学で用いられる、人類のミトコンドリアDNAハプログループ(型集団)の分類のうち、ハプログループMを祖先に持ち「4883 5178A 16362」により定義されるものである[1][2][3]

分布

ハプログループDは48000年前に東アジアで誕生し、東アジア・東南アジア・北アジア・中央アジアそしてアメリカ大陸に至るまで広範囲に観察される。形質人類学におけるモンゴロイドの分布域と概ね重なる。日本人の約41%-42%がこの系統に属する[4][5][6]D4は日本人の30%以上が属す最も高頻度のグループとなっているが、D5は僅か5%程度となっている[7][8][9][10][11][12]。長寿の傾向がある遺伝子とされている[7][8][9][10][11][12]。 中国中部が起源とされるハプログループDは、35%以上の日本人が該当する最大のグループである。 日本以外では中国や朝鮮半島にも多く、東アジア集団を特徴づけるグループといえる。「稲作の民」の祖先は、中国中部で原始的な稲作を開始し、その技術とともに日本へやって来たことで 弥生時代の到来に貢献したと考えられている。

下位系統

大別すると「D4」と「D5・D6」という2つの系統がある。

脚注

  1. van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). "Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation". Human Mutation 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID:18853457. Retrieved 2009-05-20.
  2. ハプログループ D (mtDNA), https://www.asianprofile.wiki/wiki/Haplogroup_D_(mtDNA) , www.asianprofile.wiki, (2022-03-09), en, hmong.wiki
  3. "Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock Supplementary material" (PDF). 2009. pp. page89.
  4. 4.0 4.1 Asari M, 2007, Utility of haplogroup determination for forensic mtDNA analysis in the Japanese population , Leg Med, vol 9, issue 5, p237–240, doi:10.1016/j.legalmed.2007.01.007, pmid:17467322
  5. 5.0 5.1 Umetsu Kazuo, Tanaka Masashi, Yuasa Isao, 2005, Multiplex amplified product-length polymorphism analysis of 36 mitochondrial single-nucleotide polymorphisms for haplogrouping of East Asian populations, Electrophoresis , vol 26, issue 1, p91–98, doi:10.1002/elps.200406129, pmid:15624129
  6. 6.0 6.1 Maruyama Sayaka , Minaguchi Kiyoshi, Saitou Naruya, 2003, Sequence polymorphisms of the mitochondrial DNA control region and phylogenetic analysis of mtDNA lineages in the Japanese population, Int J Legal Med, vol 117, issue 4, p218–225, doi:10.1007/s00414-003-0379-2, pmid:12845447
  7. 7.0 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 新版 日本人になった祖先たち―DNAが解明する多元的構造 (NHKブックス No.1255), 2019-03-25, NHK出版, 篠田謙一
  8. 8.0 8.1 8.2 8.3 8.4 8.5 DNAで語る 日本人起源論 (岩波現代全書), 2015-09-19, 岩波書店, 篠田謙一, 第7章
  9. 9.0 9.1 9.2 9.3 9.4 9.5 いつでもLOUPE:「現代日本人のもつDNA」, http://blog.livedoor.jp/nara_suimeishi/archives/51936203.html, blog.livedoor.jp, (2022-03-09)
  10. 10.0 10.1 10.2 10.3 我々はどこから来たのか-最新研究からわかる弥生時代~古墳時代のヤポネシア人のDNAについて にっぽん ってどんな国?, https://jpnhist.com/archives/1268, にっぽん ってどんな国?, (2022-03-09), ja
  11. 11.0 11.1 11.2 11.3 古代史とミトコンドリア(mitochondria), https://enkieden.exblog.jp/20932564/, 古代史探訪,(2022-03-099, ja
  12. 12.0 12.1 12.2 12.3 篠田謙一さんが語る、ミトコンドリアDNAでたどる人類の起源(1/2), , https://bigissue-online.jp/2013/11/08/shinoda-san-1/, BIG ISSUE ONLINE, (2022-03-09), ja
  13. 13.0 13.1 テンプレート:Cite journal
  14. East Asian mtDNA haplogroup determination in Koreans: haplogroup-level coding region SNP analysis and subhaplogroup-level control region sequence analysis
  15. Kong Qing-Peng, Yao Yong-Gang, Liu Mu, 2003, Mitochondrial DNA sequence polymorphisms of five ethnic populations from northern China, Hum Genet, vol 113, issue 5, p391–405, doi: 10.1007/s00439-003-1004-7, pmid:12938036
  16. Zheng H-X, Yan S, Qin Z-D, Wang Y, Tan J-Z, 2011, Major Population Expansion of East Asians Began before Neolithic Time: Evidence of mtDNA Genomes, PLoS ONE, vol 6, issue 10, pe25835, doi:10.1371/journal.pone.0025835, pmid:21998705, pmc:3188578
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  22. Catherine Hill, Pedro Soares, Maru Mormina et al., "A Mitochondrial Stratigraphy for Island Southeast Asia", Am. J. Hum. Genet. (2007);80:29–43.
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  25. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC524407/
  26. 第10回 | いま注目の最先端研究・技術探検! | 中高生と“いのちの不思議”を考える─生命科学DOKIDOKI研究室.{{{date}}} - via {{{via}}}.
  27. Tanaka M et al. 2004, Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan Genome Res. 2004. 14: 1832-1850
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